Ранее для станции были также изготовлены 8 комплектов оборудования гидротурбин. До конца 2012 года производитель обязан поставить СШГЭС ещё два аналогичных комплекта. Помимо этого ОАО «Силовые машины» произвели крупногабаритное оборудование для гидроагрегатов станции (маслованны подпятников генераторов, рабочие колеса гидротурбин, остовы роторов вспомогательных генераторов). Контракт на поставку, шеф-монтаж и пуско-наладочные работы перечисленной продукции был заключён в ноябре 2009 г.

 В 2010 г. на станции были восстановлены менее пострадавшие гидроагрегаты (№6, 5, 4, 3), которые начали работать в базовом режиме. В 2011 г. «РусГидро» принялось за второй этап реконструкции, в ходе которого машинный зал Саяно-Шушенской ГЭС получит 10 совершенно новых гидроагрегатов. Четыре ныне действующие машины тоже будут заменены.

 Начиная с декабря 2011 г. на объекте введены в эксплуатацию гидроагрегаты №1, 7 и 8. До конца текущего года в работу будет запущен агрегат со станционным номером 9.

 План-график восстановления СШГЭС предполагает ежегодный запуск трёх гидроагрегатов (до 2014 г.). В результате станция будет полностью оснащена новым оборудованием с улучшенными рабочими характеристиками.